Buscando un artículo de alta puntuación sobre el progreso de la investigación del posicionamiento de genes

El posicionamiento de genes es un paso importante en la investigación genética. La determinación de la posición de los genes ayuda a comprender la función del gen; el posicionamiento de un gen también ayuda a posicionar aún más otros genes en el mismo cromosoma o grupo sintético. El mapeo genético juega un papel importante en la comprensión de las bases de las enfermedades genéticas en el campo médico, la selección asistida por marcadores genéticos en la producción animal y la comprensión de las reglas genéticas de los rasgos económicos. En investigaciones recientes sobre tecnología transgénica, el mapeo genético es un medio necesario para determinar la posición de integración del gen donante y el transgén en el cromosoma receptor. Así como la invención del mapa ayudó a la gente a comprender el mundo, el posicionamiento de los genes ha proporcionado a la humanidad una comprensión profunda de los fenómenos y las leyes biológicas, lo que tiene una importancia trascendental.

Con el desarrollo de la tecnología de mapeo genético, la connotación de su concepto también ha seguido profundizándose. El mapeo genético temprano se refiere principalmente a distinguir si los genes están vinculados o no, y si están ubicados en autosomas o cromosomas sexuales. Actualmente, incluye mapeo genético para comprender la posición relativa de los genes en grupos de ligamiento y mapeo físico para comprender la ubicación específica de los genes en un cromosoma. Además de los genes de rasgos de calidad, el contenido de posicionamiento también incluye genes QTL y marcadores genéticos moleculares (principalmente loci de microsatélites, RFLP, etc.). Existen varios métodos para la localización cromosómica de genes, entre los cuales los principales métodos de localización física incluyen la hibridación in situ fluorescente tradicional (FISH) y la localización híbrida por radiación (RH). Aunque la tecnología FlSH puede realizar el posicionamiento cromosómico de genes, desde una perspectiva molecular, su trabajo de posicionamiento aún es difícil. El posicionamiento RH es más preciso que el posicionamiento FlSH, tiene un bajo costo y una alta eficiencia de posicionamiento. desempeñan un papel cada vez más importante en la investigación genética.

Luego puede analizar el posicionamiento de genes en una dirección:

Por ejemplo, arroz: /Periodical_xmdxxb200706023.aspx

Cerdo: actualmente se utiliza para el posicionamiento físico de genes de cerdos. Las líneas celulares híbridas de células somáticas más populares incluyen: el panel híbrido de células somáticas de cerdo × roedor francés (SCHP), la Academia Francesa de Ciencias Agrícolas y el panel de clonación híbrida irradiada de la Universidad de Minnesota (INRA-panel híbrido de radiación porcina de Minnesota (IMpRH). El panel híbrido de radiación Sus scrofa (SSRH) de Japón y el panel híbrido de radiación porcina construido conjuntamente por Roslin Research en el Reino Unido y la Universidad de Cambridge (Lin Li, 2004). Los dos primeros se utilizan actualmente con mayor frecuencia. La mayor similitud entre los dos es que ambos se basan en la tipificación por PCR, lo cual es conveniente y rápido.

El panel híbrido de células somáticas de roedor y cerdo fue construido por el Instituto Francés de Ciencias Agrícolas (Laboratoire de Génétique Cellulaire, INRA, Castanet-Tolosan, Francia) y consta de 27 líneas celulares híbridas (Yerle, et al. , 1996). Las células donantes utilizadas en este panel híbrido somático son linfocitos o fibroblastos porcinos, que luego se combinan con la línea celular deficiente en xantina fosforribosiltransferasa (HPRT-) de hámster chino (línea celular híbrida 1-19) y con deficiencia de timina quinasa de ratón (TK-). ) se fusionaron líneas celulares (20-27 líneas celulares híbridas) y finalmente se identificaron mediante métodos citogenéticos. Al detectar los resultados de tipificación de un determinado gen en 27 líneas celulares híbridas mediante PCR y luego analizar la correspondencia con los cromosomas de cerdo o fragmentos retenidos en cada tipo de célula híbrida, se pueden obtener los resultados de posicionamiento regional del gen en los cromosomas de cerdo ( Chevalet et al., 1997). Este método sólo puede localizar genes en ubicaciones cromosómicas relativamente aproximadas.

El panel de clonación híbrida de cerdos irradiados IMpRH fue construido conjuntamente por la Academia Francesa de Ciencias Agrícolas y la Universidad de Minnesota en los Estados Unidos (Yerle, et al., 1998). Después de irradiar linfocitos porcinos o células donantes de fibroblastos con una dosis de radiación de 7.000 Rads, se fusionaron con células receptoras de hámster chino para obtener 152 clones de células híbridas utilizando FISH (pequeño elemento repetido intercalado) como sonda y después de la identificación citogenética específica de los mismos. tamaño y longitud de los cromosomas o fragmentos restantes en cada línea celular híbrida utilizando como cebador la tecnología PRINS con SINE, se obtuvo un conjunto de 118 líneas celulares híbridas, abarcando toda la placa del genoma porcino (IMpRH) (Yerle et al., 1998). . Hawken et al. (1999) utilizaron IMpRH para construir por primera vez el mapa híbrido de radiación del genoma completo porcino localizando más de 900 marcadores de clase I y clase II. El mapa se compone de 128 grupos de enlace (el valor LOD mínimo del locus es 4,8) y 59 marcadores individuales, que cubren todos los autosomas y cromosomas X. La resolución teórica es de 145 kb y la tasa de supervivencia promedio es de aproximadamente 70 kb/. cR. La construcción del primer mapa híbrido de radiación de cerdos proporcionó abundantes marcadores de ADN para el posicionamiento de nuevos marcadores de ADN y sentó las bases para la construcción de mapas físicos de alta resolución del genoma porcino. Por lo tanto, este conjunto de placas de clonación ha sido ampliamente utilizado. . Dado que el método RH es un método de posicionamiento basado en la tecnología de detección de tipificación por PCR e Internet, para la placa IMpRH de 118 clones, bajo las condiciones de cebadores específicos, alta eficiencia de amplificación y condiciones estables, los resultados del análisis se pueden enviar al correspondiente laboratorio en el sitio web de un día y obtenga el resultado de posicionamiento final, por lo que tiene las características de precisión de posicionamiento rápida, simple y alta, y los resultados también son comparables. En comparación con los mapas de ligamiento, las placas de clones híbridos irradiados pueden posicionar y organizar marcadores con relativa precisión, y pueden clasificar un grupo de marcadores con posiciones indistinguibles dentro de una región de 5 cM en mapas de ligamiento genético (Rohrer et al., 1996; Hawken et al. , 1999; Lin Li, 2004). Además de localizar marcadores de ADN específicos, con el enorme crecimiento de las bases de datos de tecnologías ecológicamente racionales, el método RH para localizar tecnologías ecológicamente racionales también muestra amplias perspectivas de aplicación. Cirera et al. (2003) utilizaron con éxito IMpRH para localizar 214 EST secuenciados de una biblioteca de ADNc en el intestino delgado; Tuggle et al (2003) también utilizaron IMpRH para localizar 64 EST expresados ​​principalmente en órganos reproductivos de cerdas.

Espero que esto ayude