Utilizo el siguiente código de Matlab para convertir imágenes en videos, a veces lo logra y otras no.

Según la información que publicó, en el primer caso, la imagen es una matriz de estructuras 0x1, es decir, una matriz vacía, ¿verdad? ¿Está seguro de que obtuvo los resultados que deseaba después de ejecutar el programa?

Si el primer caso es correcto, entonces en el segundo caso, la resolución de cada imagen puede ser diferente.