archivos faltantes de primier5
Las funciones principales del cebador se dividen en cuatro partes principales, tres de las cuales se usan comúnmente, a saber, el diseño del cebador (cebador), el análisis del sitio de corte de la enzima de restricción (enzima) y la búsqueda de motivos (motivo). Otra función es el análisis de homología (Allign), que no es la especialidad de Premier y se omitirá aquí. El software también tiene otras funciones, como "lectura" de secuencias, intercambio de secuencias de ADN y proteínas (Protein), indicaciones sonoras para la entrada del teclado, etc., pero la mejor de ellas es la capacidad de diseñar cebadores degenerados.
Pasos de uso:
Después de iniciar el software Premier y abrir una secuencia, la interfaz es la siguiente:
Las funciones principales son claras de un vistazo en la página principal (las funciones de los botones son las siguientes) arriba). El análisis del punto de corte de la enzima de restricción y la búsqueda de motivos son relativamente simples. Después de hacer clic en este botón de función, seleccione la enzima de restricción o el motivo correspondiente y presione Aceptar. Generalmente se pueden encontrar enzimas de restricción y motivos comunes. También se pueden editar o añadir enzimas de restricción o motivos.
Para realizar el diseño de imprimación, haga clic en el botón "Primer". La interfaz es la siguiente:
Haga clic en el botón "buscar", como se muestra en la Figura 2, y aparecerá la ventana de criterios de búsqueda. Aparecerá, con una variedad de parámetros para ajustar. Hay tres opciones para fines de búsqueda (Buscar), cebadores de PCR, cebadores de secuenciación y sondas de hibridación. Tipo de búsqueda (Tipo de búsqueda) puede elegir buscar los cebadores ascendentes y descendentes (Sens/Anti-sense Primer) por separado (Ambos), o buscar en pares (Pairs), o utilizar principalmente los cebadores superior e inferior respectivamente (Compatible con Sense). / Imprimación antisentido). Además, también puede cambiar el área de selección (Rangos de búsqueda), la longitud del cebador (longitud del cebador), el modo de selección (modo de búsqueda), la selección de parámetros (parámetros de búsqueda), etc. Los investigadores pueden establecer varios parámetros según sus propias necesidades. Si no hay requisitos especiales, se recomienda utilizar la configuración predeterminada. Luego presione "Aceptar". Cuando se muestre la búsqueda completa en la ventana de progreso de la búsqueda que aparece, presione "Aceptar" nuevamente.