¿Puede VisualStudio 2010 reemplazar el software de configuración para crear animaciones y pantallas que se comuniquen con los PLC?

Absolutamente.

Se desarrolla software de configuración, pero no necesariamente tiene que utilizar Visual Studio. Existen muchas herramientas de software de desarrollo en el mercado, VS es solo una de ellas.

VS puede crear una pantalla, que es equivalente a la interfaz de Windows. No hay problema de comunicación y se puede desarrollar. En cuanto a qué lenguaje usar para el desarrollo, los más utilizados ahora son c#. JAVAetc.