La diferencia entre las plataformas de secuenciación de alto rendimiento Illumina HiSeq 2000 y Roche454

Son plataformas de secuenciación de dos compañías diferentes

1. Principio

Hiseq2000 y 454 de Illumina amplifican señales a través de amplificación de secuencia única. Hiseq2000 tiene amplificación de puente. medio y se puede secuenciar en ambos extremos. En términos de longitud de secuenciación, Hiseq2000 generalmente tiene modos 1X100 y 2X100, mientras que 454 tiene un promedio de aproximadamente 500 pb y el más largo es de aproximadamente 700. En términos de precisión de secuenciación, la precisión de secuenciación de Hiseq es ligeramente mayor que 454 agrega uno cada vez durante el proceso de secuenciación. Si hay repeticiones de una sola base, como AAAA, entonces la precisión para distinguir varias A disminuirá.

2. Análisis de datos y dirección de la aplicación

El análisis de datos no es muy diferente, es solo un software diferente. Ambos tienen sus propias ventajas en la aplicación y la adaptabilidad de los datos de Hiseq2000 es mayor. 454 generalmente se utiliza mejor para la secuenciación de abundancia de poblaciones metagenómicas, pero Illumina también tiene MIseq en su lugar.

3. Flujo y precio

El flujo de HISEQ2000 es mayor y el precio es mucho más económico que el 454.

En términos generales, el rango de aplicación de 454 es relativamente estrecho ahora, por lo que se está reemplazando gradualmente en el mercado. Ahora los consumibles y reactivos pronto estarán fuera de servicio.

Sin embargo, Hiseq cuenta actualmente con 2500 modelos en el mercado, y también hay modelos 3000 y 4000 con nuevas actualizaciones tecnológicas. Para ser honesto, hoy en día hay muy pocos Hiseq2000.