Cuando se conoce una determinada secuencia en el medio, utilizando ARN como plantilla, se puede saber que el extremo del ARNm de la plantilla contiene poli(A) y se puede realizar una reacción de carrera. Perplejo

Todos los ARNm eucariotas contienen poli (A), y la poli(A) polimerasa añade poli A durante la modificación postranscripcional.

El proceso detallado es el siguiente:

1 Los dos complejos proteicos de factor específico de escisión y poliadenilación (CPSF) y factor activador de escisión (CstF) se unen a la ARN polimerasa II.

2 Cuando la ARN polimerasa II avanza a través de la secuencia señal de poliadenilación (AAUAAA), CPSF se unirá a la secuencia AAUAAA y CstF se unirá a la secuencia GU posterior o a la secuencia llena de U.

3 CPSF y CstF escindirán aproximadamente el nucleótido 35 después de la secuencia AAUAAA. La poli(A) polimerasa (PAP) inicia la síntesis de la cola de poli(A) en el sitio de escisión. La proteína de unión a poli(A) (PABPN1) en el núcleo se une inmediatamente a la nueva secuencia de poli(A).

4 CPSF comienza a disociarse, mientras que PAP continúa poliadenilándose y escribiendo una cola de adenosina de unos 50-250 nucleósidos (dependiendo de la especie de organismo). PABPN1 actúa como una regla molecular y define cuándo se detiene la poliadenilación.

5 PAP abandona el ARNm, mientras que PABPN1 continúa unido.

Por tanto, el ARNm contiene poli A en el ADNc obtenido tras la transcripción inversa, por lo que se pueden realizar reacciones de carrera en función de esta característica.