Cómo analizar los sitios de glicosilación de proteínas y el peso molecular después de la glicosilación, sitio web de predicción

1. Métodos para analizar los sitios de glicosilación:

1. Métodos experimentales:

Análisis por espectrometría de masas: La espectrometría de masas (MS) se utiliza para determinar la glicosilación de proteínas. estándar de oro para los sitios. Mediante análisis MS/MS de péptidos específicos, se pueden identificar sitios específicos de glicosilación.

Inmunotransferencia: Detección mediante anticuerpos específicos para los sitios de glicosilación.

2. Predicción bioinformática:

Software de predicción y bases de datos: como NetNGlyc (predice sitios de N-glicosilación), NetOGlyc (predice sitios de O-glicosilación), GlycoEP et al.

Los pasos para usar estas herramientas generalmente incluyen: ingresar la secuencia de aminoácidos de la proteína objetivo; seleccionar el tipo de glicosilación (N- u O-glicosilación; ejecutar predicciones para obtener sitios potenciales de glicosilación); resultados de predicción, normalmente estas herramientas dan una puntuación de confianza.

2. Predicción del peso molecular después de la glicosilación:

1. Cálculo teórico:

Después de conocer el sitio de glicosilación y su tipo, podemos determinar el tipo y el número. de cadenas de azúcar añadidas estiman el cambio en el peso molecular.

2. Espectrometría de masas:

El peso molecular global de las proteínas glicosiladas se puede medir directamente mediante espectrometría de masas. Los cambios de masa debidos a la glicosilación se pueden determinar analizando las diferencias de pico entre las formas glicosiladas y no glicosiladas.