Cómo instalar gromacs en MacBook
(1) Descomprimir el código fuente de fftw, lam-mpi y gromacs
tar -zxvf fftw-3.1.2.tar.gz
p>tar -zxvf gromacs-3.3.1..tar.gz
tar -zxvf lam-7.1.3.tar.gz
(2) Compilar lam - mpi
cd lam-7.1.3 ./configure --prefix=/home/lam-7.1.3 --sin-fc --with-rsh="ssh-x"
make
make install
Nota: - without-fc no se usa para compilar mpif77, puedes eliminarlo
(3 ) Agregar variable de entorno mpi
exportar PATH=$PATH:/home/lam-7.1.3/bin (agregar a .bashrc)
(4) Compilar fftw de precisión simple/doble versión
cd fftw-3.1.2
./configure --enable-float --enable-mpi --prefix=/home/fftw-3.1.2
make
make install
make distclean
./configure --disable-float --enable-mpi --prefix=/home/fftw - 3.1.2
(3) Establecer variables de entorno fftw
exportar CPPFLAGS=-I/home/fftw-3.1.2/include
exportar LDFLAGS= - L/home/fftw-3.1.2/lib
(4) Compilar gromacs
cd gromacs-3.3.1
./configure --prefix = /home/gromacs-3.3.1 --enable-mpi
make
make install
make distclean
./configure - -prefix=/home/gromacs-3.3.1 --program-suffix=_d --enable-mpi --disable-float
(5) Establecer variables de entorno de gromacs
export PATH=$PATH:/home/gromacs-3.3.1/bin (añadir a .bashrc)
(6) Compile otros archivos en el paquete de código fuente de gromacs (opcional)
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