¿Cómo iniciar un programa usando comandos y GUI de Linux?

"start d:" y "explorer d:" tienen el mismo efecto en Windows, por lo que estás en Linux.

¿Por qué no simplemente llamar a los 3 que quieres ejecutar?

Por ejemplo, en gnome, llame a "Nautilus./" para ver si puede usar nautilus (que administra archivos en gnome) para abrir el directorio actual. Olvídese de si el comando nautilus es su propio nombre.