¿Ubuntu utiliza apt para instalar software?

No exactamente, pero apt es más conveniente.

También puedes:

dpkg

Compilar el código fuente (./configure && make install)

Usar el instalador de archivos binarios distribuidos por el proveedor , similar a Windows

rpm

Utilice el script proporcionado por el editor (install.sh install.rb install.py...)

cp foo / usuario/bin/