SWISS-MODEL--Predicción de la estructura terciaria de la proteína objetivo

Pasos del proceso:

A. Determinar la plantilla: encontrar una estructura proteica conocida que sea homóloga a la proteína objetivo como plantilla (la coherencia entre la secuencia objetivo y la secuencia plantilla debe ser ≥30).

B. Alineación de secuencia: cree una alineación de secuencia entre la secuencia objetivo y la secuencia plantilla.

C. Modelo computacional: A través de la comparación de secuencias, los aminoácidos en la secuencia objetivo se reemplazan con las posiciones espaciales de los aminoácidos correspondientes en la estructura plantilla. Predecir modelos estructurales utilizando software de modelado de homología.

D. Evaluación de calidad: una vez que el software de modelado por homología genera el modelo estructural, también debe realizar una evaluación de calidad, cambiar la plantilla o corregir la alineación de la secuencia en función de los resultados de la evaluación, reconstruir el modelo y evaluar. de nuevo. Repita este proceso hasta que la calidad del modelo sea aceptable.

Dirección del sitio web de SWISS-MODEL: https://www.swissmodel.expasy.org/

Es una predicción en línea totalmente automática de la estructura terciaria de proteínas utilizando un método de modelado de homología.

Paso 1: Abra la URL https://www.swissmodel.expasy.org/ →Comenzar a modelar