VC vuelve a mostrar la ventana oculta por CreateProcess.

No hay un camino directo. Use EnumWindows para enumerar la ventana, luego use GetProcessIidFromHwnd para obtener la identificación del proceso de la ventana y compárela con la identificación del proceso que creó hasta que sea la misma. Esta ventana es lo que estás buscando.

Las funciones anteriores pueden tener algunas diferencias de carácter. No puedo recordarlos claramente. No tengo msdn o vc instalado, así que no puedo comprobarlo por ti. En resumen, se trata de enumerar las ventanas, obtener el ID del proceso a través del identificador de la ventana y compararlo con el proceso uno por uno hasta que sean iguales.