Programación en lenguaje R: calcule el coeficiente de correlación de Pearson entre mRNA y lncRNA según los niveles de expresión

Prólogo: Al construir una red de ceRNA, es necesario calcular la correlación de expresión entre el lncRNA y los genes codificadores de proteínas (genes pc), generalmente utilizando el coeficiente de correlación de Pearson. ¿Cómo hacerlo específicamente?

2. Obtener la matriz de expresión del ARNm

La matriz de expresión de 4 genes en 100 muestras:

3. Calcular la correlación de expresión entre el lncRNA y el gen

Utilice la función cor() para calcular el coeficiente de correlación de Pearson. Es así de simple: