¿Se puede utilizar la placa base Thin-ITX en una caja Mini-ITX?

Sí. Las placas base Thin-ITX en realidad tienen las mismas especificaciones que las placas base mini-ITX, excepto que son más delgadas (utilizan memoria y ranuras para portátiles). La fuente de alimentación generalmente es enchufable y se puede colocar en un chasis más pequeño.

En definitiva, las placas base de los dos son del mismo tamaño y se pueden utilizar en cajas ITX.