¿Se advertirán las consultas de subdominios?

Sí.

En el navegador, cuando intentas acceder al contenido bajo este nombre de dominio, se generará un salto interno y automáticamente saltará a una solicitud HTTPS. Si el certificado TLS enviado por el servidor no es válido, el usuario no puede ignorar la advertencia del navegador y continuar visitando el sitio web. En circunstancias normales, si el certificado no es válido, el navegador dará una advertencia, pero el usuario aún puede optar por continuar accediendo para ignorar la advertencia. Pero si HSTS está activado, el navegador no le permitirá omitir la advertencia.