¿Cómo evitar que se carguen algunos códigos js y css cuando los usuarios acceden a ellos en teléfonos móviles?

El back-end determina qué sistema es, como PHP. Si no es un teléfono móvil, generará la etiqueta del script. También puede usar el front-end para administrar el código. El cargador de módulos como requirejs o seajs determina si es un teléfono móvil y no se requiere el archivo correspondiente.