CoMFA y CoMSIA para relaciones conformacionales cuantitativas
CoMFA y CoMISA son actualmente uno de los métodos de diseño racional de fármacos más utilizados. Creen que la interacción entre las moléculas del fármaco y los receptores depende de la diferencia en el campo molecular alrededor del compuesto. El análisis de regresión de variables sobre la actividad de los fármacos puede reflejar el patrón de interacción entre fármacos y macromoléculas biológicas, permitiendo así el diseño selectivo de nuevos fármacos.
Coloque la molécula en una caja y mueva las partículas sonda en la caja.
El método de campo molecular comparativo superpone moléculas con el mismo anillo estructural principal en el espacio para que sus direcciones espaciales sean lo más consistentes posible. Como sea posible, las partículas de la sonda luego se mueven en el espacio alrededor de las moléculas, calculan la interacción entre las partículas de la sonda y las moléculas y registran los valores de energía de las interacciones en diferentes coordenadas en el espacio, obteniendo así datos del campo molecular. Diferentes partículas de sonda pueden detectar diferentes propiedades de los campos moleculares alrededor de las moléculas. Las moléculas de metano se pueden usar como sondas para detectar campos tridimensionales, las moléculas de agua se pueden usar como sondas para detectar campos hidrofóbicos y los iones de hidrógeno se pueden usar como sondas para detectar campos electrostáticos. , etc. Algunos maduros El programa de campo molecular comparativo puede proporcionar docenas de partículas de sonda para que los usuarios elijan.
La información del campo molecular obtenida por las partículas sonda se utiliza como variable independiente en el análisis de regresión de datos de actividad fisiológica molecular. Dado que el campo molecular tiene una gran cantidad de información y son datos químicos de alta dimensión, se deben tomar medidas para reducir la dimensionalidad de los datos durante el proceso de análisis de regresión. El método más utilizado es el método de regresión de mínimos cuadrados parciales. Además, el método de análisis de componentes principales también se utiliza para el análisis de datos.