Parámetros estructurales para relaciones conformacionales cuantitativas
Los parámetros estructurales son otro elemento importante de las relaciones conformacionales cuantitativas. Los parámetros estructurales comunes incluyen: parámetros hidrofóbicos, parámetros eléctricos, parámetros tridimensionales, parámetros geométricos, parámetros topológicos, parámetros físicos y químicos y parámetros estructurales puros.
*Parámetros de hidrofobicidad: La absorción y distribución de los fármacos en el organismo están estrechamente relacionadas con la hidrofobicidad. La hidrofobicidad es una característica importante que afecta a la actividad fisiológica de los fármacos. El parámetro de hidrofobicidad más comúnmente utilizado en relaciones conformacionales cuantitativas bidimensionales es el coeficiente de partición lípido-agua, que se define como la relación de partición de una molécula entre octanol y agua. Para los sustituyentes en el anillo original de la molécula, se suman los valores logarítmicos de los coeficientes de partición lípido-agua y los parámetros de hidrofobicidad de una determinada estructura sustituida se pueden obtener mediante cálculos algebraicos simples.
* Parámetros eléctricos: Los parámetros eléctricos en la relación estructura-actividad cuantitativa bidimensional heredan directamente las definiciones de parámetros eléctricos en la fórmula de Hamilton y la fórmula de Taft, y se utilizan para caracterizar el impacto de los sustituyentes en el conjunto. Distribución de electrones de la molécula. Su valor también es aditivo para los sustituyentes.
*Parámetros estéreo: Los parámetros estéreo caracterizan el impacto de las interacciones entre grupos intramoleculares en la conformación farmacodinámica y el modo de unión de fármacos y macromoléculas biológicas. Los parámetros estéricos comúnmente utilizados incluyen los parámetros estéricos de Tuffeto, el índice de refracción molar y el radio de van der Waals.
* Parámetros geométricos: Los parámetros geométricos son parámetros tridimensionales relacionados con la conformación molecular. Debido a que estos parámetros a menudo ocupan una determinada posición en las relaciones conformacionales cuantitativas, se consideran por separado de los parámetros geométricos comúnmente utilizados. incluyen área de superficie molecular, área de superficie accesible al solvente, volumen molecular, parámetros tridimensionales multidimensionales, etc.
* Parámetros topológicos: Parámetros estructurales utilizados en métodos de conectividad molecular. Entre los parámetros, los parámetros topológicos codifican átomos de acuerdo con la estructura topológica de la molécula y utilizan la codificación formada para caracterizar la estructura molecular.
* Parámetros físicos y químicos: los momentos dipolares, los datos espectrales moleculares, los niveles de energía orbital frontal, las constantes de disociación ácido-base y otros parámetros físicos y químicos a veces se utilizan como parámetros estructurales para estudios conformacionales cuantitativos.
* Parámetros estructurales puros: En el método Free-Wilson se utilizan parámetros estructurales puros, que toman como estándar de referencia la molécula de una estructura específica y se basan en los grupos funcionales del anillo padre de la estructura. La estructura molecular se codifica según la presencia o ausencia de grupos funcionales en el anillo principal de la estructura y luego se realiza un análisis de regresión para calcular el coeficiente de regresión de cada grupo funcional, obteniendo así un modelo cuantitativo de relación estructura-actividad.