Al configurar un servidor que ejecuta PHP, ¿es mejor usar Linux o Windows?

Si solo configuras php, entonces puedes usar apache+php. Básicamente no hay gran diferencia si es en Windows o Linux.

Si también quieres ejecutar otras cosas. asp, Asp.net, etc., es mejor usar Windows, porque iASP en Linux no tiene un buen soporte para asp. No conozco otros métodos.

php funciona más lento que asp.net, pero avanza constantemente. Creo que tiene un futuro brillante.