Trama del juego Contra 3

En 2636 d.C., los extraterrestres, reacios a sufrir repetidas derrotas, finalmente lanzaron una guerra de agresión a gran escala contra la Tierra. Frente a la abrumadora tecnología extraterrestre, la humanidad quedó indefensa por un tiempo y se retiró constantemente. Ante los ataques del enemigo, Bill y Lance, los guerreros legendarios del equipo Contra que derrotaron dos veces a los alienígenas, recibieron una vez más la orden de destruir directamente el sistema central del enemigo para ayudar a los humanos a lanzar un contraataque.