¿Dónde se colocan los archivos en la programación Java?

Generalmente, si hay muchas imágenes, puede crear un servidor de archivos independiente. Como fastdf o algo así. Luego, las lecturas se guardan llamando a la API del servidor de archivos.

Si el contenido de la imagen es pequeño, puedes utilizar un servidor ftp.

Si se trata de una imagen utilizada en el programa, puedes crear directamente una carpeta de imágenes en el proyecto para guardarla.