Matlab hace la línea del marco y es obvio que las dos medias están en 0. ¿Por qué el segundo es más bajo cuando se juntan? ¡Por favor dame algún consejo!

A juzgar por los resultados de ejecución del programa, no hay ningún problema con el programa y el dibujo es correcto. Es posible que el problema que mencionaste no exista. Puedes verlo cambiando la última frase:

Gráfico, diagrama de caja (F3)

Gráfico, diagrama de caja (F4)

Gráfico, diagrama de caja Imagen (w)

Los resultados se pueden ver al comparar las tres imágenes.